Lichtenstein, S. K. (1999). Literaire polyfonie. Een theoretisch ontwerp en zijn toepassing op een passage in Thomas Manns 'Der Erwahlte'. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam]. in eigen beheer.
IJdo, J. W. (1999). Human granulocytic ehrlichiosis. [Thesis, externally prepared, Universiteit van Amsterdam].
Vriesema, A. J. M. (1999). Adaptive gene expression of endocarditis-causing viridans group streptococci and Staphilococcus aureus. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam].
Heijenbrok, F. J. (1999). Neointima formation in rat carotid arteries. Pharmacological and morphological investigations. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam].
Teusink, B. (1999). Exposing a complex metabolic system: glycolysis in Saccharomyces cerevisiae. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam].
Jager, Z. (1999). Processes of tidal transport and accumulation of larval flounder (Platichthys flesus L.) in the Ems-Dollard nursery. [Thesis, externally prepared, Universiteit van Amsterdam].
Biemans, P. J. (1999). Professionalisering van de personeelsfunctie: Een empirisch onderzoek bij twintig organisaties. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam]. Eburon.
Kootstra, N. A. (1999). HIV-1 replication in macrophages. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam].
Petra, D. G. I. (1999). Asymmetric transfer hydrogenation of ketones. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam].
van Wijk, G. J. (1999). Hoezo noodzakelijk? Rechtsgronden voor kinderbeschermingsmaatregelen. [Thesis, fully internal, Universiteit van Amsterdam]. Thela Thesis.